玻璃钢水箱虽然有诸多优点，但也存在一些缺点，主要体现在以下几个方面：
物理性能方面
- 刚性相对不足：相较于金属材质水箱，玻璃钢水箱的刚性稍差。在装满水等较大压力工况下，可能会出现一定程度的变形。特别是大尺寸、大容量的水箱，若设计或安装不当，变形风险会更高，这可能影响水箱的外观及使用性能，严重时甚至可能导致渗漏。
- 抗冲击能力有限：玻璃钢材质的抗冲击性能不如一些金属材料。在受到外力撞击时，如在安装过程中或使用环境中有异物碰撞等，玻璃钢水箱更容易出现裂纹、破损等情况，进而影响水箱的密封性和使用寿命。
材料老化方面
- 易老化：玻璃钢水箱长期暴露在自然环境中，尤其是紫外线辐射较强的地区，或者长期处于高温、潮湿等恶劣环境条件下，其材质中的树脂等成分容易发生老化。老化后水箱的性能会逐渐下降，如强度降低、表面出现裂纹、颜色变深等，影响水箱的整体质量和使用安全性。
- 寿命受环境影响大：由于老化问题，玻璃钢水箱的实际使用寿命与使用环境密切相关。在一些极端环境下，可能无法达到预期的使用寿命，需要提前进行更换，增加了使用成本。
制作与安装方面
- 制作工艺要求高：玻璃钢水箱的制作质量对工艺要求较为严格。如果在制作过程中，玻璃纤维与树脂的比例不当、铺设不均匀或者固化工艺控制不好等，都可能导致水箱存在内部缺陷，如气泡、分层等，从而降低水箱的性能和质量。
- 现场安装复杂：大型玻璃钢水箱通常需要在现场进行组装，安装过程相对复杂。需要专业的技术人员和工具，且对安装场地和环境有一定要求。如果安装过程不规范，如连接部位密封处理不好，容易出现漏水等问题。
其他方面
- 修复难度大：一旦玻璃钢水箱出现损坏，修复起来相对困难。由于其材质特性，修复后的效果可能不如原始状态，难以完全恢复水箱的性能和外观。而且修复成本可能较高，尤其是对于一些大面积或严重的损坏。
- 价格较高：相比一些普通材质的水箱，如塑料水箱等，玻璃钢水箱的价格通常较高。这是因为其原材料成本、制作工艺等因素导致整体成本上升，在一定程度上会影响其在一些对成本敏感的应用场景中的推广和使用。
